一般情况下可以用棉签和其他工具轻轻地刮出来，动作需要温和，避免使用牙刷等硬物来防止出血和感染。
大多数扁桃体结石发生在扁桃体的上隐窝。这种长期阻塞、分泌物排水不良和奶酪状物质的积累导致钙和镁等不溶性无机盐的沉积。通常情况下可以用棉签等工具轻轻刮取结石，要温柔，不要用牙刷等坚硬的物体，以免出现感染或出血。有条件的病人可以定期用牙刷清除扁桃体结石，清洁时要小心，要温柔，不要用太大的压力，将冲洗机的压力调至一个较低的位置，然后将冲洗装置打开，并小心地避免接触到石头；尝试用水流冲刷石头，使其稳定，直至石头松动，再排出。如果不能用清洁工具清理结石，可以用消毒棉或刮刀，轻轻地将结石从扁桃体内的结石中刮出来。
扁桃体结石需要注意：首先，患者的饮食应尽量清淡易消化，多喝水以保持大便通畅，多吃新鲜水果和蔬菜，补充维生素，适当吃一些清热和灭火的食物，如苦瓜、冬瓜等。其次，康复前，避免辛辣和刺激性食物，尽量避免油腻的食物，避免硬的、难以吞咽或消化的食物，像松脆的骨头和坚果，以免刺激喉咙，还有吸烟和饮酒习惯的患者最好戒烟戒酒。最后，养成良好的口腔卫生习惯，早晚刷牙，饭后漱口，避免细菌吸入引起的疾病复发，注意口腔护理的动作要轻柔，试着用软牙刷清洁你的嘴；还有平时注意锻炼，提高身体抵抗力，避免过度工作，保持充足的睡眠与良好的睡眠质量，预防感冒。
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