肌腱囊肿患者的治疗，一般需要根据患者肌腱囊肿的大小、临床症状的严重程度，而采取保守治疗或者是手术治疗的方式。
对于较小的肌腱囊肿、临床症状较轻的肌腱囊肿患者，患者通常选择采取保守治疗的方式，如限制囊肿处肌腱的活动量，患者需要尽量佩戴护具或者护腕等，从而减少患者囊肿肌腱处的活动量。另外，患者也可以给予局部的温热毛巾热敷理疗，或者是涂具有活血化瘀作用的中成药，如红花油或者正骨水等药物，都可以减轻肌腱囊肿的体积。对于伴有疼痛的肌腱囊肿患者，则可以给予对症地使用非甾体类的消炎药，如芬必得、扶他林等。而对于体积较大的肌腱囊肿患者，或者是经以上治疗效果不佳的肌腱囊肿患者，则需要采取手术彻底切除的方式，进行对症治疗。肌腱囊肿患者通常是由于肌腱损伤后导致腱周的结缔组织形成无菌性炎症，腱膜变薄，滑液变薄突出所导致患者出现囊肿。腱鞘因外伤或劳损导致鞘膜损伤变薄，正常鞘内的滑液自薄弱处突出形成囊肿。肌腱和腱鞘患者囊肿部分一般是可以自行吸收的，时间较长的囊肿，需要手术切除囊肿和周围粘连的结缔组织，术后需要限制患者的活动，一周后逐步进行关节的功能锻炼，患者在三周内应尽量避免剧烈重体力活动。
患者在日常生活中需要注意，为患者提供舒适的居住环境，经常开窗通风，保持室内空气清新。患者还应注意休息，避免过度使用肌肉，促进机体恢复，患者需要加强营养，多食用高蛋白的食物，如牛奶、鱼、蛋等。
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