嘴巴里长泡的治疗，需根据其引起的病因不同进行综合评估。其可能是由于病毒感染、创伤性黏膜血泡、黏液腺囊肿等原因引起。
1、病毒感染
单纯疱疹病毒1型所引起的嘴巴里长泡，患者会出现牙龈红肿，一般为成簇的小水泡，在成年人就是复发性疱疹一般发生在牙龈颚侧，也是成簇的水泡，通常为病毒感染所引起的黏膜的水泡。应选用抗病毒药物，如阿昔洛韦、喷昔洛韦乳膏或凝胶涂抹，可迅速起效。刚开始长唇疱疹时患部发痒，此时患者便可涂药，可以防止疱疹长出，若已经起疱，应及时涂抹抗病毒药物，如复方四季青软膏、龙珠软膏等，通常5天左右能够愈合。
2、创伤性黏膜血泡
创伤性黏膜血泡主要为创伤因素所引起，比如患者食用硬脆的食物，一撞把黏膜底下的血管碰破而形成血泡。可局部涂擦0.5%龙胆紫或用消炎药水含漱，如自行破裂成溃疡；也可将疱膜剪除，冲洗创面，局部也可用氯己定等漱口液含漱消毒，给消炎止痛药物，预防继发感染；创面大、有感染时应口服广谱抗生素，如头孢他啶、头孢米诺等。
3、黏液腺囊肿
口腔黏液腺囊肿主要表现为发生在口腔黏膜下的一些半透明的小水泡。常规治疗方式是手术切除。采用手术切除的方式，主要是将小唾液腺和周围形成潴留的涎液一并切除；对婴幼儿粘液腺囊肿的治疗，可以通过药物注射、打碘酒、硬化药物等使腺体分泌功能下降，最终导致肿瘤萎缩或消失；部分患者还可使用缝线的方法，造成新瘘口使涎液外流，最终使囊肿消失。
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