绝大部分炎症是由细菌及其产生的毒素引起的，对炎症的治疗也必然是消灭细菌。由于口腔中寄居着大量厌氧菌，因此需要在受伤之后及早的使用抗厌氧菌药物来预防厌氧菌感染。常见的口腔抗菌药物有硝基咪唑类药物、广谱抗生素和糖皮质激素。
1.硝基咪唑类药物
第一代为甲硝唑，第二代为替硝唑，第三代为奥硝唑，临床使用各有特点。这3种药均有片剂及针剂，口服或加入静脉点滴均可。甲硝唑的不良反应有恶心、呕吐、食欲不振等，可与维生素B6合用，以减少胃肠反应，有胃病者最好改服替硝唑或奥硝唑。替硝唑广泛用于厌氧菌感染和原虫疾病的预防和治疗。奥硝唑禁用于脑和脊髓病变患者、癫痫病、各种器官硬化病及造血功能低下者。此外，部分女性患者服药后常出现头痛头昏及全身无力等症状。
2.广谱抗生素
口腔各种炎症以厌氧菌感染为主，用药也应从抗厌氧菌的硝基咪唑类药入手，再联合使用其他抗生素，如非化脓性炎症可使用作用较弱但抗菌谱广的抗生素，如大环内酯类抗生素（螺旋霉素、罗红霉素等）；化脓性炎症多为革兰氏阳性菌感染，使用青霉素（青霉素G钾、青霉素钠等）类及头孢类（头孢氨苄等）的药较合适。但是为避免细菌出现抗生素耐药性，对体质较好的中青年患者，轻度炎症去除病因及局部用药即可，尽量避免全身用药。
3.糖皮质激素
其抗炎原理是抑制炎症受损细胞释放“炎症促进因子”，减轻局部充血并降低毛细血管通透性，从而减少渗出，并抑制炎症细胞浸润，以减轻炎症反应。对于口颌面部严重感染，或受到较严重创伤时，可联合使用地塞米松进行治疗。
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