凌晨三点头晕可能是由于颈椎病、脑血管疾病以及风寒感冒等原因所致。需要及时去医院查询病因，对症治疗。
1、颈椎病
由于颈椎增生，椎间盘病变、突出，压迫到神经和血管等原因造成。尤其是脊髓型颈椎病，在体位不正确的情况下就会出现头晕，如睡觉长时间侧卧位，有时伴有头痛、恶心、呕吐症状。所以建议患有颈椎疾病的患者，在睡觉时枕的枕头不要太高，平时不要长时间低头，避免久坐。注意颈部防风寒、防潮湿，加强颈部肌肉锻炼，比如颈椎保健操、通过蛙泳强化颈部肌肉，保护颈椎。如有必要，可以通过适当的颈椎牵引改善症状。
2、脑血管疾病
脑血管病是指脑血管病变引起脑功能障碍的一类疾病总称，包括由于脑动脉粥样硬化、脑血栓形成脑血管狭窄或闭塞等引起的一系列脑部疾病，分为缺血性脑血管病和出血性脑血管病。常见的为小脑、脑干梗死，是一种急性缺血性脑血管疾病，患者主要表现为头晕、恶心、呕吐，也可以出现平衡障碍和共济障碍，患者为安静状态下或者睡眠中起病，大多数有动脉粥样硬化、高血脂、高血糖以及高同型半胱氨酸血症。也有可能是脑供血不足，主要是动脉粥样硬化造成的，主要是因为高血脂、糖尿病，血液粘稠度增加、动脉粥样硬化、管腔狭窄、管壁僵硬，在睡眠时会出现血流速度降低，从而造成脑供血不足。患者会出现头晕，主要给予改善血液循环治疗，可以口服银杏叶滴丸等，同时控制患者的血脂和血糖。
3、风寒感冒
风寒感冒，也可以导致凌晨三点头晕。风寒感冒主要是由于病毒感染引起的，在病毒感染之后，会导致人体出现发热、头痛、头晕的现象。一定要注意休息，保持良好的睡眠，要多喝温开水促进排尿，同时口服连花清瘟胶囊、感冒灵颗粒、苦甘颗粒等药物治疗。在饮食上要注意清淡，多吃蔬菜和水果，少吃油腻、辛辣和刺激性的食物。
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